Catatan Gol, Persipura Masih Jadi Tim Tersebut di Kasta Tertinggi Sepak Bola Indonesia

1994-1995: 40
1995-1996: 56
1997-1997: 34
1997-1998: 24
1998-1999: 15
1999-2000: 37
2001 : 30
2002 : 45
2003 : 66
2004 : 39
2005 : 37
2006 : 27
2007-2008: 62
2008-2009: 81
2009-2010: 62
2010-2011: 63
2013 : 82
2014 : 42
2015 : 7
2017 : 64
2018 : 2
Ket.: tanpa menghitung skor adu penalti dalam babak gugur, data hingga pekan pertama Liga 1 2018.