Banyak pemain inti seperti Jaimerson Xavier, Maman Abdurrahman, Andritany Ardhiyasa, Rezaldi Hehanussa, Sandi Sute, dan Rohit Chand, yang tidak diturunkan.
Hanya Ismed, Novri Setiawan, Marko Simic, Ramdani Lestaluhu, dan Riko Simanjuntak yang dimainkan.
Tiga nama terakhir juga bermain pada babak kedua.
Disimpannya pemain inti sebagai persiapan Persija menghadapi Home United dalam laga leg kedua semifinal Zona ASEAN Piala AFC 2018 di SUGBK, Selasa (15/5/2018).
Dalam laga itu, Persija harus meraih kemenangan minimal 1-0 melawan Home United untuk melaju ke final Zona ASEAN Piala AFC 2018.
"Saya kira kami bukan melepas pertandingan melawan Madura United demi menjamu Home United, tapi segala sesuatu emang Madura United bermain bagus ketimbang kami," kata Ismed.