Meskipun ia pernah bermain untuk ketiga klub tersebut, namun Thomas tak mampu meraih penghargaan bergengsi dalam kariernya.
Namun prestasinya seiring berubah semenjak ia pensiun sebagai pesepak bola dan beralih menjadi pelatih.
Ia mengawali kariernya sebagai seorang pelatih dengan menukangi tim U-19 Hamburger SV pada tahun 2001.
Semenjak saat itu, karier kepelatihannya perlahan naik hingga menukangi tim senior Hamburger SV pada tahun 2004 silam.
Baca Juga: Persebaya Surabaya Kontrak Pemain yang Dibuang Persija Jakarta
Setahun setelah menukangi Hamburger SV, Thomas akhirnya mendapatkan sebuah trofi yang cukup bergengsi pada masa itu.
Tepatnya di tahun 2005, Thomas mampu membawa Hamburger SV menjuarai Piala Intertoto.
Hamburger SV mampu mengalahkan Valencia di partaai final Piala Intertoto.
Mereka mampu memenangi laga melawan Valencia dengan skor agregat 1-0 setelah melangsungkan dua leg pertandingan.
Puncak karier seorang Thomas Doll adalah ketika dirinya mendapat tawaran menjadi pelatih klub raksasa asal Jerman, Borussia Dortmund, pada 2007 lalu.